Departamentul Agriculturii din SUA a postat în această săptămână o versiune nepublicată a acesteia analiza genetică în răspândirea și răspândirea gripei aviare la bovinele de lapte din SUAoferind cea mai completă privire până acum asupra datelor pe care anchetatorii federali și de stat le-au adunat în focarul neașteptat și îngrijorător – și ce ar putea însemna.
Analiza preprint oferă mai multe perspective semnificative asupra focarului – de când este posibil să fi început efectiv, cât de multă transmitere ne lipsește, necunoscute uimitoare despre singura infecție umană legată de focar și cât de mult continuă să evolueze virusul la vaci. . Informațiile sunt esențiale, deoarece experții în gripă se tem că focarul crește riscul mereu prezent ca acest virus viclean al gripei să se răspândească în rândul oamenilor și să declanșeze o pandemie.
Dar, informațiile nu au fost ușor de găsit. Din 25 martie, când USDA a confirmat pentru prima dată că o turmă de vaci de lapte din SUA a contractat virusul gripal aviar H5N1, foarte patogen, agenția a strâns critici internaționale pentru că nu a partajat rapid sau complet datele. Pe 21 aprilie, agenția a aruncat peste 200 de secvențe genetice în bazele de date publice, pe fondul presiunii experților externi. Cu toate acestea, multe dintre aceste secvențe nu au metadate descriptive, care în mod normal conțin informații de bază și cheie, cum ar fi când și unde a fost prelevată proba virală. Experții din afara nu au acele informații cruciale, ceea ce face ca analizele independente să fie limitate în mod frustrant. Astfel, noua analiză USDA – care include probabil acele date – oferă cea mai bună imagine încă a informațiilor complete despre focar.
Răspândire nedetectată
Una dintre cele mai importante concluzii este că cercetătorii USDA cred că răspândirea gripei aviare de la păsările sălbatice la vite a început la sfârșitul anului trecut, probabil în decembrie. Astfel, virusul a circulat probabil nedetectat la vacile de lapte timp de aproximativ patru luni înainte de confirmarea USDA din 25 martie a unei infecții într-o turmă din Texas.
Această concluzie cronologică se aliniază în mare măsură cu ce experți externi culeși anterior din datele limitate disponibile publicului. Deci, s-ar putea să nu-i surprindă pe cei care au urmat focarul, dar este îngrijorător. Luni de răspândire nedetectată ridică îngrijorări semnificative cu privire la capacitatea țării de a identifica și de a răspunde rapid la focarele emergente de boli infecțioase și dacă răspunsurile de sănătate publică au depășit pașii greșiți observați în etapele incipiente ale pandemiei de COVID-19.
Dar o altă descoperire importantă din preprint este cât de multe lacune există încă în înțelegerea noastră actuală a focarului. Până în prezent, USDA a identificat 36 de efective în nouă state care au fost infectate cu H5N1. Vestea bună din analiza genetică este că USDA poate trasa linii care leagă majoritatea dintre ele. Cercetătorii USDA au raportat că „mișcarea directă a vitelor bazată pe practicile de producție” pare să explice modul în care H5N1 a sărit din regiunea Texas panhandle – unde se crede că a avut loc răspândirea inițială – în alte nouă state, unele la fel de îndepărtate ca Carolina de Nord. Michigan și Idaho.
Căi de transmitere presupuse ale HPAI H5N1 clada 2.3.4.4b genotip B3.13 susținute de legături epidemiologice, mișcări ale animalelor și analize genomice. [/ars_img]Vestea proastă este că acele linii care leagă turmele nu sunt solide. Există lacune în care datele genetice sugerează că a avut loc o transmitere neidentificată, poate la vacile neeșantionate, poate la alte animale în întregime. Datele genetice sunt clare că, odată ce această tulpină de gripă aviară – H5N1 clada 2.3.4.4 genotipul B3.13 – a ajuns la bovine, s-ar putea răspândi cu ușurință la alte mamifere. Datele genetice leagă virușii de la bovine care s-au mutat de multe ori către alte animale: au existat cinci sărituri de la bovine la păsări de curte, o transmitere de la bovine la raton, două evenimente în care virusul s-a mutat de la bovine la pisici domestice și de trei ori când virusul. de la vite vărsate înapoi în păsările sălbatice.
„Nu putem exclude posibilitatea ca acest genotip să circule în locații și gazde neeșantionate, deoarece analiza existentă sugerează că datele lipsesc, iar subsupravegherea poate ascunde transmiterea dedusă prin metode filogenetice”, au scris cercetătorii USDA în preprintul lor.
Comentarii recente